Аудит провадиться у відповідності до вимог та рекомендацій ДСТУ ISO 19011:2019 «Настанови щодо здійснення аудитів систем управління»
Критеріями аудиту є вимоги ДСТУ ISO/IEC 17025:2017, політики та методики НААУ (Документи НААУ) , нормативно правові акти, що поширюються на діяльність лабораторії.